Para apoiar os beneficiários de projectos na gestão e execução dos projectos aprovados, foi realizado e colocado on-line o Guia de Gestão. Este Guia está composto por várias fichas relativas aos diferentes aspectos da gestão administrativa, física e financeira, bem como do plano de comunicação dos projectos. Pode ser descarregada na secção "Gestão dos projectos aprovados" da página da internet do Programa.

Nessa mesma secção, os beneficiários podem encontrar as indicações e documentos modelo estabelecidos pelos Estados-membros para proceder à selecção do controlador de primeiro nível.

Trata-se de um procedimento novo na gestão financeira dos projectos, em relação às práticas realizadas no Programa INTERREG IIIB SUDOE. O controlador de primeiro nível corresponde à etapa que consiste na validação das despesas efectuadas no quadro de um projecto SUDOE, na verificação da sua adequação aos regulamentos nacionais a comunitários, bem como na comprovação do fornecimento de bens e serviços co-financiados. Excepto no caso do Reino Unido (Gibraltar), que dispõe de um sistema centralizado, os beneficiários do resto dos Estados-membros do Espaço SUDOE, devem propor ao seu correspondente nacional respectivo um controlador de primeiro nível que terá por missão realizar as tarefas mencionadas. Os correspondentes nacionais de cada Estado-membro deverão aceitar ou recusar o controlador proposto por cada beneficiário, de acordo com as condições estabelecidas, bem como verificar os controles que este realiza ao longo de todo o projecto.

Os guias e modelos para a selecção do controlador de primeiro nível e para a validação posterior da despesa estão disponíveis na página da internet do Programa.

O processo de selecção e de designação do controlador de primeiro nível, tal como o conjunto dos procedimentos a seguir durante a execução dos projectos, deve ser efectuado através da Aplicação Informática do Programa. Este programa informático, desenvolvido « à medida » para a gestão do Programa e dos projectos SUDOE, pretende centralizar toda a informação sobre o desenvolvimento dos projectos. Esta ferramenta vai permitir aos órgãos de gestão do Programa melhorar o acompanhamento do projectos e a execução do Programa, melhorando, sobretudo, a pista de auditoria e o acesso à informação essencial. O desenvolvimento e a implementação da Aplicação Informática surge da vontade dos órgãos de gestão de melhorar a gestão e o acompanhamento do Programa e dos projectos com vista, sobretudo, a encurtar os prazos do circuito financeiro, procurando recorrer, o mínimo possível, ao envio de documentos em papel tendo por objectivo a preservação do meio ambiente.